Сделать домашней|Добавить в избранное
 

Біологічний факультет
Миколаївського національного університету
ім.В.О.Сухомлинського

 
» » Откуда в хромосоме петли

Откуда в хромосоме петли

Автор: GLaDos от 31-10-2015, 11:04

Мы научились читать последовательность ДНК, однако до сих пор плохо представляем себе, как наша двухметровая ДНК укладывается в микроскопическом клеточном ядре. Известно, что геном человека разбит на 46 хромосом (мы говорим о диплоидном хромосомном наборе, то есть когда каждая хромосома представлена материнской и отцовской копиями), и каждая из них представляет собой сложнейший белково-нуклеиновый комплекс, в котором можно выделить несколько уровней компактизации – ДНК многократно сворачивается, сгибается, чтобы занимать как можно меньше места. Сама она свернуться до такой степени не может, ей должны помогать белки гистоны, и взаимодействие её с гистонами на разных этапах укладки до сих пор активно изучается молекулярными биологами. И хотя слово «хромосома» сейчас известно всем, не сказать, чтобы мы полностью представляли, как она устроена.

Раньше думали, что человеческая ДНК образует около миллиона петель, но оказалось, что их гораздо меньше – порядка 10 тысяч. У них есть специальная «скрепка», белок CTCF, по молекуле которого сидит на каждой нити в точке их соединения. Такие петли собирались в крупные хромосомные отделы-компартменты, а те, в свою очередь, в ещё более крупные субкомпартменты.

Новая модель вынудила пересмотреть некоторые популярные представления об организации хромосомы. На самом нижнем уровне компактизации нить ДНК наматывается на молекулярные шайбы, сложенные из белков гистонов; как ранее полагали, такие шайбы, называемые нуклеосомами, укладываются в высокоорганизованную нить-фибриллу длиной 30 нанометров. Со временем стали накапливаться данные о том, что в реальности, в живой клетке ДНК организована не так жёстко, однако только вот такой пересчёт петель прямо показал, что 30-нанометровые фибриллы, если и существуют, то лишь на определённых этапах жизни клетки.

Как формируются петли? Учитывая, что белок CTCF служит им застёжкой, и что у него есть специальные места связывания в ДНК, можно было бы предположить, что пара CTCF сразу садится на эти участки, а ДНК просто протягивается через белковый комплекс, подобно тому, как мы протягиваем через узел шнурок на ботинке. Однако модель, которую те же авторы вместе с коллегами из Университета Райса, Стэнфорда и Института Броуда предлагают в своей новой статье, выглядит иначе: в ней уже сформировавшийся комплекс из двух молекул белка садится на любой участок ДНК, после чего нить нуклеиновой кислоты начинает протягиваться через «скрепку». ДНК-петля растёт до тех пор, пока не белки CTCF не встретят в ней свои последовательности, с которыми они прочно связываются. То есть выпетливание идёт до тех пор, пока не сработает «застёжка», а сработает она тогда, когда встретятся оба её компонента: белковый комплекс и определённая последовательность нуклеотидов, которую эти белки «любят».

Формирование ДНК-петель моделировали на компьютере. Однако, во-первых, она согласуется с ранее полученными экспериментальными данными, в том числе и относительно поведения белка CTCF. Во-вторых, с её помощью удалось предсказать результаты новых опытов, в которых из ДНК либо удаляли, либо добавляли последовательности связывания с CTCF, после чего анализировали изменения в укладке цепи нуклеиновой кислоты – исчезновение и появление пространственных структур в ДНК было таким, какое показывала модель.

 

Запетливание ДНК нужно не только для того, чтобы её можно было компактнее уложить. В геноме есть специальные регуляторные области, называемые промоторами и энхансерами, которые нужны для управления транскрипцией, синтезом РНК на ДНК. Промоторы и энхансеры связываются с особыми белками, с помощью которых и влияют на активность генов. Энхансеры обычно действуют на промоторы, однако давно было замечено, что они находятся довольно далеко от тех последовательностей, с которыми работают. Но это если представлять ДНК в виде прямой нити – в свете новых данных становится понятно, как регуляторные участки ДНК могут управлять работой далеко отстоящих от них генов.

Также очевидно, что механизм запетливания хромосомы сам по себе играет роль одного из важнейших механизмов регуляции генетической активности.

 Теперь исследователям предстоит понять, как такие петли и белок CTCF взаимодействуют с молекулярными машинами ремонта ДНК, её удвоения и синтеза РНК.

 

Журнал "Наука и жизнь"

 

 

Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь.
Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо войти на сайт под своим именем.

Комментарии:

Оставить комментарий
  • mogila

  • 9 ноября 2015 21:58
  • Группа: Посетители
  • ICQ:
  • Регистрация: 9.11.2015
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 1
  • Публикаций: 0
^
научная статья, посвященная CTCF, с участием Биологического факультета МНУ:

журнал: BMC Biol. 2015 Aug 7;13:63. doi: 10.1186/s12915-015-0168-7.

название: Functional role of dimerization and CP190 interacting domains of CTCF protein in Drosophila melanogaster.

авторы: Bonchuk A1, Maksimenko O2, Kyrchanova O1, Ivlieva T1, Mogila V1,3, Deshpande G4, Wolle D4, Schedl P5,6, Georgiev P7.

работа выполнена в следующих научных учреждениях:

1,2,5,7 Institute of Gene Biology, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russia.

3 Department of Biology, Nikolaev V.A. Sukhomlinsky National University, Nikolaev, Ukraine.

4,,6 Department of Molecular Biology, Princeton University, Princeton, NJ, USA.

Abstract
BACKGROUND:
Insulators play a central role in gene regulation, chromosomal architecture and genome function in higher eukaryotes. To learn more about how insulators carry out their diverse functions, we have begun an analysis of the Drosophila CTCF (dCTCF). CTCF is one of the few insulator proteins known to be conserved from flies to man.
RESULTS:
In the studies reported here we have focused on the identification and characterization of two dCTCF protein interaction modules. The first mediates dCTCF multimerization, while the second mediates dCTCF-CP190 interactions. The multimerization domain maps in the N-terminus of the dCTCF protein and likely mediates the formation of tetrameric complexes. The CP190 interaction module encompasses a sequence ~200 amino acids long that spans the C-terminal and mediates interactions with the N-terminal BTB domain of the CP190 protein. Transgene rescue experiments showed that a dCTCF protein lacking sequences critical for CP190 interactions was almost as effective as wild type in rescuing the phenotypic effects of a dCTCF null allele. The mutation did, however, affect CP190 recruitment to specific Drosophila insulator elements and had a modest effect on dCTCF chromatin association. A protein lacking the N-terminal dCTCF multimerization domain incompletely rescued the zygotic and maternal effect lethality of the null and did not rescue the defects in Abd-B regulation evident in surviving adult dCTCF mutant flies. Finally, we show that elimination of maternally contributed dCTCF at the onset of embryogenesis has quite different effects on development and Abd-B regulation than is observed when the homozygous mutant animals develop in the presence of maternally derived dCTCF activity.
  • Jeamott

  • 22 декабря 2018 15:13
  • Группа: Посетители
  • ICQ: 721680097
  • Регистрация: 18.12.2018
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 309
  • Публикаций: 0
^
Frusemide Orders Amoxicillin Side Effect Experiences cialis Viagra Ou Cialis Quel Est Le Meilleur Order Levitra On Line viagra online Buy Priligy Online Nz Levitra Rx Malegra 100 Sunrise http://truthaboutstaininggrid.com Mucinex And Antibiotics Keflex Together Comment Acheter Viagra Hors Pharmacie Sale isotretinoin cheap legally mastercard accepted viagra Propecia Insomnia Sildenafil 100mg Med viagra Hydrochlorothiazide Cheapeast El Paso Viagra Achat Kamagra cialis 5 mg Venta De Viagra Original Healthy Man Generic Viagra Suppliers

--------------------
  • Группа: Посетители
  • ICQ: 285223661
  • Регистрация: 25.10.2018
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 2
  • Публикаций: 0
^
Федеральная торговая комиссия США (FTC) оштрафовала соцсеть для публикации коротких музыкальных видео TikTok на 5,7 миллиона долларов за нарушение закона о защите конфиденциальности детей в интернете (Children's Online Privacy Protection Act, COPPA). Это самый большой в истории штраф за нарушение данного закона.

Как пишет TJ, в FTC пришли к выводу, что сервис нелегально собирал персональные данные пользователей младше 13 лет без согласия их родителей. Регулятор не только оштрафовал компанию, но и обязал удалить все видео, загруженные подростками.

"Учетные записи общедоступны по умолчанию. Это означает, что другие пользователи могут просматривать биографию, имя пользователя, фотографию и видео в профиле ребенка. Хотя сервис позволял поменять настройки приватности так, чтобы следить за аккаунтом могли только подтвержденные пользователи, фотографии в профиле и биография оставались в общем доступе – а другие пользователи могли отправлять детям личные сообщения", – говорится в пресс-релизе FTC. В день публикации сообщения о штрафе сервис TikTok обновил приложение: теперь детям младше 13 лет запрещено загружать в соцсеть видеоролики, но они по-прежнему могут снимать их при помощи приложения и просматривать контент других пользователей. Представители компании также пообещали дополнительно защитить данные юных пользователей.

Как отмечает издание TechCrunch, эти ограничения вряд ли изменят ситуацию, поскольку подростки могут легко обойти запрет на публикацию контента, указав другую дату рождения – так дети поступают в Facebook и Snapchat. Сервис TikTok позволяет синхронизировать песни и собственное исполнение, как в караоке. В настоящее время сервис, ранее известный под названием Musical.ly, насчитывает свыше 500 млн пользователей, а большинство из них составляют дети.

Взять срочные займы на карту онлайн до 2000 рублей, можно у наших финансовых спонсоров:
http://www.pestinfo.ru/forum/index.php?PAGE_NAME=profile_view&UID=385
https://msetka.ru/forum/user/3886/
http://www.rsn.ru/forum/?PAGE_NAME=profile_view&UID=15380
http://volleymsk.com/forum/?PAGE_NAME=profile_view&UID=153
http://auditxp.ru/forum/user/17852/

--------------------
  • Группа: Посетители
  • ICQ:
  • Регистрация: 16.03.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 27
  • Публикаций: 0
^
when viagra kicks in
generic viagra online
buy viagra cheap
<a href="http://viagrxragen.com/#">generic viagra online</a>
  • Группа: Посетители
  • ICQ:
  • Регистрация: 7.03.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 26
  • Публикаций: 0
^
buy cialis professional
buy cialis
buy cialis online cheap
<a href="http://cialisgengrx.com/#">buy cialis online</a>

--------------------
  • Группа: Посетители
  • ICQ:
  • Регистрация: 2.03.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 28
  • Публикаций: 0
^
http://cialisggnrx.com/
and poppers cialis 20mg
buy generic cialis online
buy cialis generic
<a href="http://www.cialisggnrx.com/#">buy cialis online</a>

--------------------
  • abrask

  • 27 марта 2019 15:19
  • Группа: Посетители
  • ICQ:
  • Регистрация: 26.03.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 28
  • Публикаций: 0
^
<a href="http://chcialisnrx.com/#">buy cheap cialis online</a>
<a href="http://cialisgenhrx.com/#">buy cheap cialis online</a>
<a href="http://cialisgenkrx.com/#">buy cheap cialis online</a>
  • addIcky

  • 10 апреля 2019 16:35
  • Группа: Посетители
  • ICQ:
  • Регистрация: 28.03.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 24
  • Публикаций: 0
^
<a href="http://cialisndbrx.com/#">buy generic cialis online</a>
<a href="http://cialismnrx.com/#">buy generic cialis online</a>
<a href="http://cialisgentrx.com/#">buy generic cialis online</a>
  • Unsups

  • 11 апреля 2019 00:52
  • Группа: Посетители
  • ICQ:
  • Регистрация: 28.03.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 24
  • Публикаций: 0
^
<a href="http://viagrxragen.com/#">buy generic viagra online</a>
<a href="http://viagrabxgen.com/#">buy generic viagra online</a>
  • Группа: Посетители
  • ICQ:
  • Регистрация: 2.03.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 22
  • Публикаций: 0
^
<a href="http://cialisndbrx.com/#">buy generic cialis online</a>
<a href="http://cialismnrx.com/#">buy generic cialis online</a>
<a href="http://cialisgentrx.com/#">buy generic cialis online</a>
  • Группа: Посетители
  • ICQ:
  • Регистрация: 9.04.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 25
  • Публикаций: 0
^
<a href="http://cialisndbrx.com/#">buy generic cialis online</a>
<a href="http://cialismnrx.com/#">buy generic cialis online</a>
<a href="http://cialisgentrx.com/#">buy generic cialis online</a>
  • GualLY

  • 20 апреля 2019 07:54
  • Группа: Посетители
  • ICQ:
  • Регистрация: 9.03.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 23
  • Публикаций: 0
^
<a href="http://cialiishb.com/#">buy cheap cialis online</a>
<a href="http://cialisonrx.com/#">buy cheap cialis online</a>
  • Группа: Посетители
  • ICQ: 144177772
  • Регистрация: 1.04.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 252
  • Публикаций: 0
^
Buy Zithromax Ireland Viagra Wirkung Bei Frau online pharmacy Avis Achat Viagra Ligne Cytotec Erectile Disfunction

--------------------
  • Группа: Посетители
  • ICQ: 365673748
  • Регистрация: 7.05.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 321
  • Публикаций: 0
^
Stromectol Buy Amazon Where Can I Buy Acticin tadalafil cialis from india Amoxicilline Et Interaction Tab Doryx In Us No Prescription Needed

--------------------
  • Группа: Посетители
  • ICQ: 256571387
  • Регистрация: 31.05.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 33
  • Публикаций: 0
^
Zithromax How Supplied cialis sildenafil levitra Productos Con Finasteride Comprar Propecia Qu Est Ce Que Le Viagra

--------------------
  • Группа: Посетители
  • ICQ: 733489088
  • Регистрация: 23.01.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 49
  • Публикаций: 0
^
Kamagra Online Mastercard viagra Propecia Cost Kmart Doxcycline Compared To Amoxicillin Discount Doryx

--------------------
  • Группа: Посетители
  • ICQ: 256571387
  • Регистрация: 31.05.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 10
  • Публикаций: 0
^
Viagra Pills For Cheap viagra Buy Amoxicillin Uk No Prescription

--------------------
  • Группа: Посетители
  • ICQ: 256571387
  • Регистрация: 30.05.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 75
  • Публикаций: 0
^
Swww Healthy Man Viagra Buy Zoloft Online With No Perscription generic cialis from india Canadianhealthcaremall

--------------------
  • Группа: Посетители
  • ICQ: 163628841
  • Регистрация: 31.05.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 37
  • Публикаций: 0
^
Zithromax Dosage Kids viagra vente internet Viagra Samples From The Us

--------------------
  • Группа: Посетители
  • ICQ: 393408470
  • Регистрация: 1.01.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 2
  • Публикаций: 0
^
Cialis Y La Ceguera Moteur A Baclofen Cialis Online Offerta generic 5mg cialis best price What Is Generic Viagra Called

--------------------
  • Группа: Посетители
  • ICQ:
  • Регистрация: 21.06.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 1
  • Публикаций: 0
^
My experience with cialis pharmacy
<a href="http://cialisgentrx.com/#">buy generic cialis online</a>
what are cialis tablets cialis
<a href="http://cialischbrx.com/#">buy generic cialis online</a>
comprare cialis online pharmacy
<a href="http://bgencialisrx.com/#">buy generic cialis online</a>
  • Группа: Посетители
  • ICQ:
  • Регистрация: 21.06.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 2
  • Публикаций: 0
^
Buy brand name cialis
<a href="http://chcialisnrx.com/#">buy cheap cialis online</a>
natural forms of viagra cialis generic
<a href="http://cialischmrx.com/#">buy cheap cialis online</a>
cialis tadalafil tablets
<a href="http://cialischstgerts.com/#">buy cheap cialis online</a>
hot rod cialis pills buy
http://chcialisnrx.com/ http://cialischmrx.com/ http://cialischstgerts.com/
  • Группа: Посетители
  • ICQ: 184352514
  • Регистрация: 22.02.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 4
  • Публикаций: 0
^
viagra customs uk

--------------------
  • Группа: Посетители
  • ICQ: 184352514
  • Регистрация: 26.07.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 5
  • Публикаций: 0
^
how can i get is cheaper

b603 follow link is 50 mg
  • Группа: Посетители
  • ICQ: 184352514
  • Регистрация: 29.07.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 5
  • Публикаций: 0
^
is canada be how

82f8 ordering is india

--------------------
  • Группа: Посетители
  • ICQ: 184352514
  • Регистрация: 2.08.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 6
  • Публикаций: 0
^
is new zealand cost

70e5 is gel women uk

--------------------
  • Unerce

  • 8 августа 2019 04:43
  • Группа: Посетители
  • ICQ:
  • Регистрация: 3.08.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 2
  • Публикаций: 0
^
Cialis online prescription <a href="http://greatsteaks.com/#">cialis cheap</a> buy cialis pills generic cialis a <a href="http://ezi-learn.com/#">buy generic cialis online</a> cialis online prescription <a href="http://betsygeorge.com/#">buy cialis</a> order cialis soft <a href="http://markhollier.com/#">Buy Cheap Cialis Online</a> generic cialis daily use <a href="http://financialmomentum.com/#">Buy Generic Cialis Online</a> cheap cialis canada <a href="http://alaiweb.com/#">buy cialis online</a> cialis tablet side effects
  • Outsini

  • 23 августа 2019 08:24
  • Группа: Посетители
  • ICQ:
  • Регистрация: 23.08.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 1
  • Публикаций: 0
^
Generic cialis price <a href="http://www.cialisongen.com/#">buy cialis online</a> cialis online consultation <a href="https://cialisnorxs.com/#">buy cialis online</a> private lender <a href="http://paydaysonlinemoney.com/#">quick cash</a>
  • Группа: Посетители
  • ICQ: 184352514
  • Регистрация: 27.08.2019
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 1
  • Публикаций: 0
^
19e6 click now viagra england

how much cost a viagra
<a href="http://viagraeuw.com/">venta de viagra oeste</a>

cant get i up with viagra

--------------------
  • AaronNuh

  • 13 сентября 2019 02:11
  • Группа: Посетители
  • ICQ: 683773324
  • Регистрация: 19.10.2018
  • Статус: Пользователь offline
  • Комментариев: 456
  • Публикаций: 0
^

Назад Вперед
Наверх
Информация
Посетители, находящиеся в группе Гости, не могут оставлять комментарии к данной публикации.